ถ้าคุณบอกฉันในเดือนมกราคมว่า “จีโนมิกส์” จะกลายเป็นคำฮิตในปี 2020 ฉันคงคิดว่าคุณบ้าไปแล้วแต่การแพร่ระบาดของโควิด-19 ทำให้วิทยาศาสตร์การแพทย์ขึ้นสู่อันดับต้น ๆ ของกระดานข่าวทุกคืนของเรา และตอนนี้ ดูเหมือนว่าทุกคนกำลังพูดถึงจีโนมิกส์ ในช่วงระลอกแรกของโควิด-19 ในออสเตรเลีย การจัดลำดับจีโนมของกลุ่มตัวอย่างในซิดนีย์ที่เก่าแก่ที่สุดมีความสำคัญต่อการระบุความแตกต่างระหว่างผู้ติดเชื้อที่นำเข้าและการแพร่เชื้อในชุมชนท้องถิ่น
และตอนนี้ด้วยคลื่นลูกที่สองที่ชายแดนนิวเซาธ์เวลส์ การจัดลำดับ
จีโนมติดตามต้นกำเนิดของกลุ่มโรงแรม Crossroads ย้อนกลับไปที่ รัฐวิกตอเรีย เช่นเดียวกับที่นักวิทยาศาสตร์ชาววิกตอเรียสามารถติดตามการระบาดของเมลเบิร์นย้อนกลับไปยังกรณีการกักบริเวณโรงแรม จีโนมิกส์คือการศึกษาสารพันธุกรรมภายในสิ่งมีชีวิต — DNA (กรดดีออกซีไรโบนิวคลีอิก) และ RNA (กรดไรโบนิวคลีอิก)
การจัดลำดับจีโนมใช้ “ลายนิ้วมือทางพันธุกรรม” ของสิ่งมีชีวิตอย่างมีประสิทธิภาพและทำแผนที่ว่า DNA หรือ RNA ที่อยู่ภายในนั้นถูกสั่งอย่างไร
COVID-19 เป็นไวรัส RNA และเมื่อดูที่ลำดับพันธุกรรมของเคสต่างๆ เราสามารถตรวจพบความแตกต่างเล็กน้อยในการติดเชื้อใหม่แต่ละครั้ง
ซึ่งช่วยให้เราสามารถสร้าง “แผนผังครอบครัว” ทางพันธุกรรมเพื่อแสดงกรณี COVID-19 ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด และเพื่อระบุและติดตามคลัสเตอร์
ยิ่งเราใช้ลายนิ้วมือมากเท่าไหร่ การระบุได้ง่ายขึ้นว่ามีคนติดเชื้อ COVID-19 จากคลัสเตอร์หรือเคสที่รู้จักหรือไม่
ปลายเดือนมกราคม ผู้เดินทางที่เดินทางกลับจากฮอตสปอตในต่างประเทศแสดงอาการของไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่นี้ — แต่ไวรัสยังใหม่มาก เรายังไม่มีการทดสอบลำดับจีโนมที่พัฒนาขึ้นเพื่อพิสูจน์ว่าไวรัสมาจากที่ใด ในวันหยุดพักแรมของครอบครัวทางตอนเหนือของซิดนีย์ในช่วงวันหยุดยาววันชาติออสเตรเลีย ฉันนั่งอยู่ในเต็นท์พร้อมกับแล็ปท็อป ออกแบบ
การทดสอบลำดับจีโนมครั้งแรกของ NSW สำหรับ COVID-19
ในขณะเดียวกัน เพื่อนร่วมงานของฉันจาก University of Sydney และ NSW Health Pathology กำลังทำงานในห้องแล็บที่โรงพยาบาล Westmead เพื่อทดสอบและรวบรวมข้อมูลเพื่อดูว่าได้ผลหรือไม่
เพิ่มเติมจาก: การทดสอบจีโนมราคาถูกเพื่อทำนายความเจ็บป่วยในอนาคต? อย่ากลั้นหายใจ
จากจุดนั้น เราได้รวบรวมสารพันธุกรรมจากการทดสอบเชื้อโควิด-19 ที่เป็นบวกในรัฐนิวเซาท์เวลส์ และใช้การทดสอบลำดับที่เราออกแบบไว้ เราสามารถสร้างข้อมูลทางพันธุกรรมจากผู้ป่วยโควิด-19 จำนวน 209 ราย
การศึกษาของเราที่ตีพิมพ์เมื่อเร็วๆ นี้ในวารสารNature Medicineเผยให้เห็นวิธีที่เราใช้การจัดลำดับจีโนมและการสร้างแบบจำลองทางคณิตศาสตร์เพื่อให้ข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญเกี่ยวกับ “ความเป็นพ่อแม่” ของเคสและการแพร่กระจายของโรคในรัฐนิวเซาท์เวลส์ในช่วงสิบสัปดาห์แรกของโควิด-19 ในออสเตรเลีย
อาวุธลับของเรา: แตงโมร็อค
จำการเรียกคืนของ rockmelon ในปี 2018ได้ไหม? ซูเปอร์มาร์เก็ตทั่วออสเตรเลียถอนผลไม้ (หรือที่เรียกว่าแคนตาลูป) ออกจากชั้นวางเนื่องจากการระบาดของเชื้อลิสเทอเรีย
การจัดลำดับจีโนมถูกนำมาใช้เพื่อช่วยติดตามแหล่งที่มาของการระบาดของโรคลิสเทอเรีย และในช่วงหลายปีที่ผ่านมา เราได้ใช้มันเพื่อติดตามการระบาดของโรคอาหารเป็นพิษ รวมถึงการแพร่เชื้อของวัณโรค
เมื่อโควิด-19 ระบาดในออสเตรเลีย เราต้องรีบย้าย เราจึงเริ่มปรับการทดสอบเหล่านี้ให้เข้ากับไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่นี้ — และได้ผล
ในการวิจัยของเราในช่วงแรกๆ เราสามารถค้นพบกรณีต่างๆ ที่ไม่ได้เชื่อมโยงกับคลัสเตอร์หรือกรณีที่รู้จัก
เราพบว่าหนึ่งในสี่ของตัวอย่างที่เป็นบวกของ COVID-19 คือการแพร่เชื้อในท้องถิ่น และสามารถระบุกลุ่มตัวอย่างได้ เช่น กลุ่มที่อยู่ในสถานพยาบาล
เมื่อเปรียบเทียบลำดับจีโนมของเรากับฐานข้อมูลระหว่างประเทศเรายังระบุว่าประเทศใดที่นำเข้าไวรัสในออสเตรเลีย
เรารายงานการจัดลำดับจีโนมต่อ NSW Health เพื่อเสริมข้อมูลทางระบาดวิทยาจากการติดตามผู้สัมผัส และแจ้งและปรับปรุงการติดตามด้านสุขภาพของประชาชนกรณี COVID-19
การส่งผ่านความรู้ในชุมชนนี้นำไปสู่การปิดพรมแดนระหว่างประเทศของประเทศ การแก้ไขนโยบายการทดสอบ และมาตรการของรัฐบาลกลางและรัฐอื่นๆ ที่ออกแบบมาเพื่อลดการแพร่กระจายของไวรัสให้เหลือน้อยที่สุด
การจัดลำดับเป็นกุญแจสำคัญในขณะที่เราต่อสู้กับ COVID-19 ต่อไป
เราทราบดีว่าข้อมูลจีโนมจากการติดเชื้อไวรัสโคโรนาระลอกแรกของออสเตรเลียได้รับการพิสูจน์แล้วว่ามีความสำคัญต่อการทำความเข้าใจวิถีของโรค และยังคงช่วยให้เราสามารถถอดรหัสรหัสของกลุ่มไวรัสระลอกที่สองได้
ด้วยวัคซีนที่มีประสิทธิภาพยังคงอยู่ห่างออกไปหลายเดือน และด้วยการติดเชื้อซ้ำในออสเตรเลีย จึงจำเป็นอย่างยิ่งที่เราจะต้องลงทุนอย่างต่อเนื่องในการวิจัยนี้เพื่อพัฒนาความสามารถในการควบคุมไวรัสในระยะยาว
แนะนำ 666slotclub / hob66
